长孙无忌、杜如晦为太子左庶子，高俭、房玄龄为太子右庶子。
太子宫的左右庶子与太子詹事都为东宫核心班底，乃是太子继位后的宰相备选。
薛收、虞世南为太子中舍人。（正五品上，东宫核心文职，地位仅次于太子庶子。
掌：侍从、献纳、启奏、文翰、驳正等。相当于高级参谋+机要秘书。）
尉迟敬德为太子左卫率，程知节卫太子右卫率，马三宝卫太子监门率。
以上，为六月十二的第一批授官。
但是，为了彻底掌控朝堂，李二当然不可能不朝中央的核心岗位插手。
首先，他既然已经是监国太子，天策府都裁撤了，那个十二卫大将军的官职当然也没有了。
但是，禁军是必须要捏在手里的！
所以，七月初，李二又第二次提拔原天策府的功臣们。
首先，秦时在左卫大将军、兵部尚书、尚书右丞的官职不变的情况下，加了一个“参预朝政”的头衔，有了宰相实权！
秦时知道，李二给自己这个头衔，是想收回左卫大将军的位置。毕竟，哪有宰相还掌管禁军的？这权力实在过剩了！
只是李二没有说明，在等着秦时主动向他辞去军权，让大家都体面而已。
但是，秦时暂时只能揣着明白装糊涂了。因为已经七月了，这个时候突厥应该已经知道长安的政治格局出现巨大变化了。
颉利那个老小子，说不定已经在计划着突袭长安了。历史上赫赫有名的渭水之谋就是发生在一个多月以后。
这件事被李二视为毕生之耻！
秦时对李二耻不耻其实无所谓，让他耻一下说不定更能激发他的斗志，让他干的更好呢！？
秦时关心的是，历史上几十万突厥人进驻渭水，距离长安一步之遥。为了将这群瘟神送走，唐朝几乎搬空了国库，让本不富裕的国家雪上加霜。
所以，秦时想先留着兵权，在突厥南下时干颉利一场。
这样就算还是要拿钱打发他们，也应该能少花一些。
等这件事了，他自然会向李二辞去左卫大将军的职位。
禁军的其他各卫将领人选为：
秦琼，调任右卫大将军。
李道玄，调任左屯卫大将军。
罗士信，升任右屯卫大将军。
柴绍，调任左武侯大将军。
尉迟恭，升任右武侯大将军。
裴行俨，调任左武卫大将军。
程知节，升任右武卫大将军。
段志玄，升任左骁卫将军，领大将军职权。
侯君集，升任左卫将军。
张公瑾，升任右武侯将军。
长孙安业，升任右监门将军。
薛万彻，升任右领军将军。
七月下旬，李二再次对三省中枢进行大换血。
萧瑀，晋升右仆射。
宇文士及，晋升中书令。
高俭，晋升侍中。
房玄龄，晋升权检校中书令。
长孙无忌，晋升吏部尚书。
杜如晦，晋升刑部尚书、参预朝政。
薛收，晋升尚书左丞。
同时，因为玄武门的事情传到幽州后，李建成的准亲家、幽州大都督、庐江王李瑗十分不安，担心会被李二清算。
他的右领军将军、幽州抵御突厥的实际核心、李二的心腹爱将王君廓敏锐的看到了进步的机会。
（李瑗将王君廓视为心腹，许以儿女婚约，结为亲家。两人平日里彼此也以“亲家”相称。李瑗对王君廓可谓是言听计从，将手上的兵权都交给了王君廓。）
李二监国后，让在外坐镇一方的宗室封王们都返回长安。
赵郡王李孝恭回长安后被解除兵权，闲置；襄邑王李神符回长安后同样被解除兵权，看在秦时的面子上，李二给了他一个宗正寺少卿的差事。
在这样的背景下，李二又派崔敦礼去召李瑗回长安，李瑗哪里敢回去？但是又不敢抗命，十分纠结。
王君廓便撺掇李瑗谋反，称幽州兵强马壮，有精锐数万，还可以联系突厥为外援。就算不能反攻长安，割据一方还是没有问题的。
与其担忧被朝廷清算，还不如自己当家作主！
李瑗觉得王君廓说的很有道理，便信了他的鬼话，真的囚禁了崔敦礼造反了。
随后，王君廓就毫不犹豫地背刺了李瑗。先是杀了李瑗心腹的燕州刺史王诜，然后释放崔敦礼，突袭李瑗。
擒下李瑗后，王君廓亲手将李瑗缢杀，传首长安。
李二在七月封官时，晋升王君廓为左领军大将军、幽州都督、彭国公、加左光禄大夫。
并赐锦缎千匹，同时把李瑗全家人口、全部家产都赐给了王君