如今他又称帝，更是铁了心要改革积弊，于是便在大兴城南设立玄都坛，以此作为管理国内天师道的总部，命麾下各部祭酒都要接受玄都坛的指令，且不得世袭，所有祭酒都得有当地信徒推选，由玄都坛认可。且祭酒不得向教徒催收五斗米以外的杂税，不得修行男女合气之术，每年要严格举行三会日，所有教徒必须到场。
对于东海天师道而言，这当真是大刀阔斧的改革，不过在旁人看来，倒也无可指责。因为刘柏根的种种改革，都是为了挽回天师道在民间的形象，齐汉国内大部分人也不信天师道，反对声自然也就寥寥无几，更看不出刘柏根隐藏其中的真意。
如此改革后，刘柏根便能直接掌握国内的天师道祭酒任免，所任用的道士即是他的亲信，更是他的耳目。然后玄都坛便能以传教为名，正大光明地深入到国内各州郡，监视各方流民帅的一举一动。配合此前的大肆封爵，便能一上一下地对全局进行把控，针对性地进行治理。
只是此事说来容易，但涉及的范围极广，做起来更加耗时。因此，在称帝后约一年的时间里，他与王弥私下里一直忙于此事，以致于并没有察觉到赵汉内部的继承危机。等到石勒率兵正式包围邺城，大兴朝廷才收到消息，还没有做出决断，石勒便已经接收了邺城，并且与赵汉达成了新的协议。
此举令刘柏根大为警觉，他当即遣使去责问石勒，石勒便回复了一封诚惶诚恐的信件。
他声称自己南下是无奈之举，此地本属于义兄汲桑，汲桑当年力敌张方，有大恩于河北百姓，却不幸遭遇晋廷陷害，当地百姓深为惋惜。如今赵汉内乱，魏赵百姓便欲归附于他，他不忍拒绝。如今愿以独子石兴过继给义兄汲桑，改名汲兴，以延续义兄香火，还请大兴天子允许。
在回信最后，石勒又声称将转赠大兴天子牛羊万头，以表明自己的赤诚忠心。
刘柏根得信之后，不置可否，转头招来王弥、曹嶷、苏峻、刘灵等人，一同商议此事。
王弥读罢，自是冷笑，他对刘柏根道：“陛下，石勒真是翅膀硬了，这种鬼话也说得出，信上写得再好听，却没有半点分好处的意思。他不过是想以他那死鬼义兄的名头，全盘接手六郡膏腴之地罢了。”
此言一出，顿时得到众人响应，王璋也说道：“他以为陛下是什么人？区区万头牛羊，也值得拿来一哂？若是真臣子，就算不能一厘不少地交给朝廷，至少也要献上三郡。石勒却不念着陛下的恩情，竟然分毫不让，陛下，他这是有了反心啊！”
刘灵更是主动请战道：“还请陛下发号施令，我愿为先锋，夺回魏地，生擒这一贼胡！”
不料刘灵作为刘柏根的族弟，说出如此激昂话语后，其余人却未附和，纷纷噤声，以致现场有些尴尬。
过了片刻，曹嶷才在一旁劝道：“蔡王的忠心自是好的，只是有些不合时宜。石勒本是名将，又有两大鲜卑为援，若举兵北上，恐难速胜。而今的国家大敌乃是南人，一旦北面形成僵持，顾此失彼，南人渔翁得利，那就得不偿失了。”
这也是大多数人的想法，在眼下这个时刻，齐汉拿石勒还真没有办法，他们的首要敌人必然是南汉，双方在淮河沿线对峙，随时可能爆发冲突，不可能抽调大部分兵力北上，若以少部分兵力讨伐石勒，则又必然失败。
王弥对此评价道：“石勒这步棋虽然唐突，但确实是妙手，他是看准了才走的。陛下，我们没必要为了区区六郡之地，就和他把关系闹僵。”
他转而对刘柏根进谏：“陛下，石勒虽然难缠，对朝廷也不忠心，但还是识大体的，他之所以四处卑辞，不外乎就是明白一个道理，若我们先乱了阵脚，让刘羡得了中原，他必然也落不了什么好下场。”
“而以我当下之国力，已强过官渡之曹操，而陛下乃是仙人转世，仙福齐天，只要能击败刘羡，将他驱逐到江南，扬威九州，自然四夷宾服，又何惧他小小羯胡？陛下，以在下之见，对石勒不忙动武，还是要以安抚为主。”
听到此处，利弊已经很分明了，刘柏根低头沉吟良久，终于做出了表态，他对王弥微微颔首，继而对大众道：“燕王说得好啊！不愧是赤松子的弟子！石勒不过上党一小胡，能发展至今，却有些许时运。然华夏神州，本乃汉家之地，不须寡人出手，长久之后，必然自败。还是要以南面为重。”
“不过也不能善罢甘休，寡人要讹他一笔。”
刘柏根招来陈植道：“你去给中山王一封回信，就说，他代管魏赵之地的事，我已应允了，但既然汲桑在当地如此有人望，我也不能不有所表示。”
“我有一佳女，年方十四，正是招婿的年纪，只是一直没有好的人选，但前天晚上，无极至尊给我托梦，说今日会出现一个好的人选。”
“而今听闻汲兴已经